Железнодорожный вид транспорта является самым экологически чистым видом транспорта в мире. Несмотря на это, АО «НК «ҚТЖ» осознает важность осуществления своей производственной деятельности без ущерба окружающей среде, экологии и качеству жизни будущего поколения.

Минимизация негативного воздействия на окружающую среду достигается Компанией за счет рационального потребления природных ресурсов, последовательного сокращения выбросов, сбросов загрязняющих веществ, снижения объемов образования отходов и их повторного применения, а также использования энергосберегающих технологий.